I den originale trilogiens siste film møter vi først en ung Indiana Jones og får blant annet en forklaring på heltens legendariske frykt for slanger. Tilbake i "nåtiden" blir Jones kontaktet av en kunstsamler som foreslår at han skal finne den hellige gralen. Det viser seg at en annen arkeolog også er på jakt etter det samme relikviet, og at vedkommende har forsvunnet under jakten. Når Indiana Jones finner ut at denne arkeologen er hans egen far, tar han opp letingen - men arbeidet blir ikke akkurat lettere når han stilles overfor en hemmelig naziagent.