Nene Yashiro, eerstejaars middelbare scholier en occultist, roept 'Hanako-san van het toilet' op om haar romantische wensen te vervullen. Ze wordt Hanako's spirituele assistent en helpt hem bovennatuurlijke wezens te vernietigen en geruchten te veranderen om de geesten- en mensenwereld in evenwicht te brengen. Onderweg leert Nene over haar connectie met de geestenwereld en de duistere geheimen over Hanako's verleden.