Momoko Sakura is een basisschoolleerling die van populair idool Momoe Yamaguchi en manga's houdt. Ze wordt vaak 'Chibi Maruko-chan' genoemd vanwege haar jonge leeftijd en kleine formaat. Ze woont samen met haar ouders, haar grootouders en haar oudere zus in een klein stadje. Op school heeft ze veel vrienden met wie ze elke dag studeert en speelt, waaronder haar goede vriend Tama-chan; de leden van de studentencommissie, Maruo-kun en Migiwa-san; en het B-klasse trio: 'kleine meester' Hanawa-kun, Hamaji-Bu Taro en Sekiguchi-kun.