Masane Amaha en haar dochter Rihoko zijn op de vlucht voor een kinderbeschermingsorganisatie van de overheid die Rihoko wil afpakken van haar moeder. Ze worden gepakt en Rihoko wordt meegenomen. Ondertussen wordt Masane aangevallen door een geavanceerd wapen dat zichzelf als mens kan vermommen. Wanneer ze met het gevaar wordt geconfronteerd, komt er een vreemd licht uit haar pols en verandert ze in een krachtig wezen. Ze raakt verwikkeld in een machtsstrijd tussen machtige organisaties, waarbij zij in het middelpunt van hun aandacht staat omdat zij de grootste macht van allemaal bezit: de legendarische Witchblade.