Als rebellen de aarde belegeren, valt de verdenking op een zorgeloze erfgenaam, die zich aansluit bij een speciale militaire eenheid om het ware meesterbrein op de maan te vinden.
Jack haast zich met zijn vrienden naar een belangrijk feest en is zich niet bewust van de dreigende opstand die zijn wereld op zijn kop dreigt te zetten.
Na de aanval wordt Jack wakker in een ziekenhuis en hoort hij dat de stad in puin ligt. Hij gaat snel naar huis om antwoorden te vinden, maar krijgt bezoek van de autoriteiten.
Een verschrikkelijke tragedie doet Jack terugblikken op zijn slopende reis met de rest van het VC3-team en herinnert hem aan een belangrijk gesprek met Eric.
De volgende missie van het team: een oude bondgenoot van Bob Skylum vangen voordat het leger dat doet. Als Jack het doelwit confronteert, doet hij een schokkende ontdekking.
Terwijl het team zich inzet om de aanhoudende aanvallen af te slaan, probeert Jack de noodlottige ontmoeting een plek te geven. Kan hij Phil vertrouwen na al die tijd?
Windy infiltreert in de Goddard-basis. Het team, onder begeleiding van Mary, leert hoe het conflict tussen de aarde en de maan het leven van de maanbewoners heeft veranderd.
Terwijl Phil een nare herinnering ophaalt, komt dr. Salamandra met dringend nieuws. Op Delambre Station praat Mary met Jack over haar verleden, maar wordt ze onderbroken door Rhys.
Inanna wordt op mysterieuze wijze ziek. Mary kent iemand die haar kan genezen, maar dan zouden ze de andere kant op moeten gaan. Zal het team de omweg maken?
Het team komt eindelijk aan in de stad Agarum, maar stuit daar op een blokkade. Jack hoopt het aantal slachtoffers te kunnen beperken en neemt het heft in eigen handen.
Dr. Salamandra staakt haar gevecht met Jack om een rondrazende L-Zone tegen te houden. Ze doen hun best om de entiteit te bedwingen, maar dan verschijnt Mary plotseling.
Terwijl de losgeslagen L-Zone oprukt naar Agarum City, probeert het team het nieuws over de mysterieuze krachten van Mary te bevatten. Later komt de basis in gevaar.
Terwijl de strijd tussen de rebellen en het gezamenlijke leger voortwoedt, komt Jack in een pijnlijke confrontatie tegenover Rhys te staan. Mary doet hem een wanhopig verzoek.
Dertien jaar geleden heeft Rhys zijn eerste ontmoeting met Jack. In het heden begeeft het VC3-team zich in een gevaarlijke gevechtszone om hun doel te bereiken.
Phil blikt terug op de dag dat hij de waarheid over alles ontdekte en deelt schokkende informatie over Jacks ware doel. Dr. Salamandra ondervraagt Rhys.
Terwijl de L-Zone de stad Copernicus omsingelt, wordt Rhys door Zowan en Duan bevrijd. In een gevecht tegen rebellen staan Inanna en het team voor een moeilijke keuze.
Na een fatale krachtmeting begint de L-Zone op te spelen en slokt in alle chaos Mary op. Kunnen Phil en Jack haar en de maan redden voordat het te laat is?
