Kong speelt zich af in 2050 en wordt een gezochte voortvluchtige nadat hij een ravage heeft aangericht in het natuurhistorisch en zeereservaat van Alcatraz Island. Wat de meeste mensen op jacht naar het formidabele dier zich echter niet realiseren, is dat Kong erin is geluisd door een kwaadaardig genie dat van plan is de wereld te terroriseren met een leger van enorme robot dinosaurussen. Als het enige beest dat sterk genoeg is om de mensheid te redden van de mechanische dino's, moet Kong vertrouwen op de hulp van drie kinderen die de waarheid over hem kennen.