Ren Amamiya staat op het punt zijn tweede jaar in te gaan nadat hij is overgeplaatst naar de Shujin Academie in Tokio. Na een bepaald incident wordt zijn Persona wakker en samen met zijn vrienden vormen ze de ‘Phantom Thieves of Hearts’ om de harten van corrupte volwassenen te hervormen door de bron van hun verwrongen verlangens te stelen. Ondertussen duiken de een na de ander bizarre en onverklaarbare misdaden op. Overdag leidt de groep een gewoon leven op de middelbare school in Tokio en manoeuvreert ze na sluitingstijd door de metropool als Phantom Thieves. Laat het doek opgaan voor dit grootse, schelmenverhaal!