In het verhaal heeft Kagami Taiga zich net ingeschreven voor de Seirin High School als hij Kuroko Tetsuya van het basketbalteam van de school ontmoet. Kuroko is toevallig het schimmige zesde lid van het legendarische basketbalteam Generation of Miracles. Samen willen Kagami en Kuroko hun team naar het inter-high school kampioenschap brengen, tegen Kuroko's voormalige teamgenoten.