Ruka is een jong meisje wiens ouders gescheiden zijn en wiens vader in een aquarium werkt. Wanneer twee jongens, Umi en Sora, die door doejongs in de zee zijn opgevoed, naar het aquarium worden gebracht, voelt Ruka zich tot hen aangetrokken en begint ze te beseffen dat ze dezelfde soort bovennatuurlijke verbinding met de oceaan heeft als hen. De speciale kracht van Umi en Sora lijkt verband te houden met vreemde gebeurtenissen die steeds vaker voorkomen, zoals het verschijnen van zeedieren ver van hun thuisgebied en het verdwijnen van aquariumdieren over de hele wereld.