Tiga puluh tahun yang lalu, makhluk asing tiba di Bumi. Bukan untuk menakluki atau memberi bantuan, tetapi untuk mencari perlindungan daripada planet mereka yang hampir mati. Dipisahkan daripada manusia di kawasan Afrika Selatan yang dipanggil Daerah 9, makhluk asing itu diuruskan oleh Multi-National United, yang tidak mengambil berat tentang kebajikan makhluk asing tetapi akan melakukan apa sahaja untuk menguasai teknologi canggih mereka. Apabila ejen lapangan syarikat dijangkiti virus misteri yang mula mengubah DNA-nya, hanya ada satu tempat yang boleh dia sembunyikan: Daerah 9.