Nesilaikant alchemijos taisyklių, Edwardo Elrico pusė ekstremitų buvo atskirta nuo kūno, o jo brolio Alphonso siela susijungė su kovine. Norėdami atgauti prarastą, brolių paieška Filozofų akmenį. Neteisė ir sąjungininkai – korumpuota kariuomenė, Homunculiai ir užsienio alchemikai – pakeis Elricio brolių kelią, tačiau jų tikslas išlieka nepakitęs ir jų ryšys neišnyksta.