A.D.2027. '공안 9과'는 언제나 2군 부대로, 사건을 맡을 기회조차 좀처럼 오지 않는 곳이었다. 공안 수사를 더 이상 보고만 있을 수 없다고 생각한 육군 501기관 소속 쿠사나기 모토코 소령은, 아라마키 앞에 모습을 드러낸다. 쿠사나기 소령은 최고 수준의 체력과 전뇌 능력을 갖춘, 어느 하나 빠질 것 없는 완벽한 여성으로 흉폭한 사건을 차례차례 해결해간다. 그러나 수수께끼의 바이러스 '파이어 스타터'가 나타나면서 그녀의 일상은 돌변한다. 쿠사나기는 고뇌하면서도 그녀가 꿈꾸는 이상적인 부대를 만들어가기 위해, 여러 전뇌들과 함께 사건에 몸을 던진다. 난해한 사건을 명석한 두뇌와 체력으로 해결해가는 그녀의 활약상을 숨죽이며 지켜보자.