하츠키는 짝사랑하는 언니 하츠미와 함께 살고 있는 고등학생입니다. 하츠미의 16번째 생일날, 갑자기 녹색 빛에 둘러싸인 채 하츠키의 눈앞에서 사라져 버립니다! 그녀는 말 그대로 뚱뚱한 병아리를 닮은 존재의 도움으로 하츠미를 따라가게 되고, 결국 책 속에 담긴 다양한 세계로 가득한 '위대한 도서관'이라는 곳에 도착하게 됩니다. 하지만 하츠미는 그곳에 없었기 때문에 하츠키의 위대한 사랑을 찾기 위해 책에서 책으로 이동하는 여정이 시작됩니다.