올리버와 카즈가 일하는 비밀 슈퍼히어로 병원을 소개한다. 두 사람은 슈퍼히어로들을 위한 비밀 병원에서 꿈꿔왔던 일을 하며 액션이 가득한 모험을 겪게 된다. 사악한 스카일라는 MIGHTY MED를 장악하려 하고, 올리버와 카즈는 '애닐레이터'의 소굴을 방문하기로 결심한다. 비밀 요원 '블레일록'은 병원에 있을지 모를 스파이 문제를 해결하기 위해 돌아온다. 올리버와 카즈는 세상을 구하기 위해 전설의 원로 '하팍스'를 찾아 스카일라의 고향 행성인 '칼데라'로 떠난다. 이 병원에서 히어로들은 건강을 되찾지만, 악과의 투쟁은 여전히 치열하다.