보우저가 이전에 피치 공주와 결혼하려는 시도를 막은 뒤, 마리오와 루이지는 보우저 주니어라는 새로운 위협에 직면합니다. 그는 아버지를 감금에서 해방시키고 가문의 유산을 회복하려는 결심을 가지고 있습니다. 새롭고 옛 친구들과 함께 형제들은 별을 가로질러 젊은 후계자의 크루세이드를 막으려 합니다.