今までの苛酷すぎる人生を捨て、新天地へと旅立ったジャックは、かの地アフリカの子供たちを守るためアメリカに強制送還される。しかし、CTU時代の行き過ぎた捜査のため、公聴会にかけられたジャックは、国のインフラ防護システムの設計者が拉致されその首謀者がトニーである、とFBIから聞かされる。トニーがテロに加担するはずがない、と信じて疑わないジャックは、トニー本人に真実を確かめるべく捜査に加わる。そして、このテロ事件がサンガラでジャックの親友を殺した反政府軍へと繋がり、さらには私腹を肥やすため彼らに協力するアメリカ政府内の恐るべき腐敗をあぶりだすことになる。