Sono trascorsi 35 anni da quando l'imperatore del male Arago è stato sconfitto dai cinque Samurai Trooper, ma all'improvviso il sigillo si indebolisce e i demoni prendono di nuovo d'assalto Tokyo sterminando la popolazione. Tuttavia, stavolta il Governo è pronto a rispondere grazie alla nuova generazione di samurai della Task-Force di Difesa Speciale.