Nodoka Hanadera, una studentessa malaticcia ma ottimista delle scuole medie, si è appena trasferita a Sukoyaka City, un luogo famoso per la sua atmosfera salutare. Fa subito amicizia con due dei suoi compagni di classe: la gentile ma atletica Chiyu Sawaizumi, la cui famiglia gestisce una locanda termale, e la frizzante e alla moda figlia di un veterinario, Hinata Hiramitsu. Poco dopo il suo arrivo, Nodoka trova un cucciolo malato in una foresta, circondato da tre magici animali parlanti: Rabbirin, Penguitan e Nyatoran. Le dicono che il cucciolo, la principessa Latte, può essere curato solo sconfiggendo un mostro vicino noto come "Mega Byogen" e purificando la terra che ha corrotto. Nonostante sia impotente, Nodoka si rifiuta di arrendersi e lascia che Latte soffra.