In un futuro non troppo lontano, l'umanità si troverà ad avere a che fare con la fase successiva del suo processo evolutivo: i mutanti, persone dotate di poteri speciali che si manifestano nel corso dell'adolescenza. Temuti ed odiati dagli umani, che li vedono come un pericolo e come qualcosa di "diverso" da allontanare, alcuni di questi mutanti si radunano sotto il comando del professor Charles Xavier, anch'egli mutante e leader degli X-Men, gruppo il cui obiettivo è il raggiungimento di una pacifica coesistenza tra le due razze.