Un'eruzione vulcanica al largo della penisola di Izu risveglia un incubo sepolto da 30 anni: è Godzilla, il gigantesco mostro nato da un test atomico nel Pacifico. Nulla sembra poter fermare il colosso verde che, affamato di radioattività, si dirige prima verso la centrale nucleare di Ihama, e poi distrugge un sommergibile sovietico, causando un incidente internazionale. Sovietici e Americani fanno pressione sul Giappone, e Tokyo rischia di venire polverizzata da missili nucleari. A meno che la bizzarra teoria del professor Hayashida non si riveli esatta...