Il gruppo di corsari noto come Blue Steel continua la sua missione di consegnare i progetti del Vibration Warhead Torpedo, un'arma che potrebbe cambiare le sorti della guerra a loro favore, negli Stati Uniti. Tuttavia, una nuova minaccia nasce dal loro nemico, la schiacciante Flotta della Nebbia sotto forma di "The Student Council", un gruppo di navi da guerra composto dai rimanenti Modelli Mentali, gli avatar umanoidi delle navi, che devono ancora affrontare l'imprevedibile capitano dell'Acciaio Blu, Gunzou Chihaya. Mentre Blue Steel si avvicina alla comprensione delle origini dell'autorità che controlla il nemico, il passato di Iona rivela l'inizio della guerra e la sua ragione per schierarsi con l'umanità.