Setelah pasukan pemberontak menyerang Bumi, seorang ahli waris menjadi tersangka utama dan bergabung ke unit militer khusus untuk menemukan dalang sebenarnya di Bulan.
Jack dan teman-temannya bergegas pergi menghadiri sebuah perayaan penting, tanpa tahu bahwa akan terjadi pemberontakan yang mengancam akan menjungkirbalikkan dunianya.
Setelah serangan, Jack terbangun di rumah sakit dan mendapati kota sudah hancur. Ia bergegas pulang untuk mencari jawaban, tetapi pihak berwenang tiba-tiba menemuinya.
Setahun kemudian, pasukan VC3 mendarat di Bulan untuk melaksanakan misinya. Sementara itu, pasukan pemberontak, Moon Chains, mulai mengambil alih Kota Copernicus.
Sebuah tragedi memilukan membangkitkan kenangan Jack tentang perjalanan melelahkan bersama pasukan VC3 dan mengingatkannya akan sebuah percakapan penting dengan Eric.
Misi berikutnya pasukan VC3: menangkap sekutu dekat Bob Skylum lebih dahulu daripada Pasukan Gabungan. Jack menemukan fakta mengejutkan setelah berhadapan dengan target.
Saat pasukan VC3 kesulitan menghadapi serangan tanpa henti, Jack berusaha memahami pertemuan penting yang dialaminya. Bisakah ia memercayai Phil setelah sekian lama?
Windy menyusup ke Basis Goddard. Sementara itu, dengan dipandu oleh Mary, pasukan VC3 mengetahui pengaruh konflik Bumi-Bulan terhadap orang-orang bulan.
Phil teringat kenangan kelam saat Dr. Salamandra datang membawa berita darurat. Di Basis Delambre, Mary menceritakan masa lalunya kepada Jack saat Rhys menginterupsi.
Inanna jatuh sakit secara misterius, dan meski Mary kenal seseorang yang mampu menyembuhkannya, mereka berada di arah yang berlawanan. Akankah pasukan VC3 memutar balik?
Demi menghentikan L-Zone yang mengamuk, Dr. Salamandra meninggalkan pertarungannya dengan Jack. Mereka kesulitan menaklukkan entitas itu, hingga Mary tiba-tiba muncul.
Saat L-Zone yang memberontak bergerak maju menuju Kota Agarum, pasukan VC3 bergelut dengan penemuan kemampuan misterius Mary. Setelah itu, basis disusupi.
Saat pertempuran antara pasukan pemberontak dan Pasukan Gabungan berkecamuk, Jack menghadapi Rhys dalam konfrontasi menyakitkan. Mary mengajukan permintaan kepada Jack.
Tiga belas tahun lalu, Rhys bertemu Jack untuk pertama kalinya. Di masa kini, pasukan VC3 terjun ke medan pertempuran yang sengit untuk mencapai target mereka.
Waktu hampir habis bagi Rhys dan timnya, tetapi pertemuan kembali yang tak terduga mengacaukan misi mereka. Kemudian, Mary dan Jack merenungkan semua yang telah terjadi.
Phil menceritakan hari saat ia mengetahui kebenaran tentang semuanya dan mengungkap informasi mengejutkan soal tujuan Jack sesungguhnya. Rhys diinterogasi Dr. Salamandra.
Ketika L-Zone mengepung Kota Copernicus, Zowan dan Duan membebaskan Rhys. Dalam pertempuran dengan pasukan pemberontak, Inanna dan pasukannya menghadapi keputusan sulit.
Setelah pertarungan yang mematikan, L-Zone mulai berulah dan menarik Mary ke dalam kekacauan. Bisakah Phil dan Jack menyelamatkan Mary dan Bulan sebelum terlambat?
