Dua tahun setelah peristiwa Perang Ninja Besar Keempat, bulan yang diciptakan Hagoromo Otsutsuki sejak lama untuk menyegel Patung Gedo mulai turun ke dunia, mengancam menjadi meteor yang akan menghancurkan segalanya saat benturan. Di tengah krisis ini, keturunan langsung Kaguya Otsutsuki bernama Toneri Otsutsuki mencoba menculik Hinata Hyuga tetapi akhirnya menculik adik perempuannya Hanabi. Naruto dan sekutunya sekarang melakukan misi penyelamatan sebelum menemukan diri mereka terlibat dalam pertempuran terakhir untuk memutuskan nasib segalanya.