A 21. században járunk, mikor a technikai fejlődés észveszejtő sebességgel tágítja a lehetőségek körét, immár túl az emberin is. Az új lehetőségekkel azonban egészen új típusú bűntények jelennek meg. Vegyük mindjárt a titokzatos hackert, a "Kacagó Ember"-t, aki onnan kapta ezt a nevet, hogy évekkel ezelőtt elrabolt egy vállalati vezetőt, de hogy eltakarja saját arcát, digitálisan egy sematikus vigyorgó ábrát tett a feje elé. A legelképesztőbb bűnesetek felderítésére létrehoztak egy különleges ügynökséget, a Kusanagi Motoko őrnagy vezette 9-es szekciót, melynek főnöke a csavaros eszű Aramaki, s tagjai Batou a néha viccelődő kemény legény, Togusa a családos helyszíni nyomozó, Ishikawa a háttérinformációk gyűjtője, Saito a mesterlövész, Boma a hallgatag robbantási szakértő, s a meglehetősen sötét Pazu.