Falling Skies a káosz utáni következményekben nyílik ki, amikor egy idegen támadás teljesen működésképtelenvé tette a világ legtöbb részét. Az első invázió óta eltelt hat hónapban a túlélők egy kevés része a nagyvárosok kívül gyűjtötte össze, hogy megkezdjék a nehéz visszavágás feladatát. Minden nap egy túlélési próba, a polgári katonák védik a gondozás alatt álló embereket, miközben egy felkelési kampányt folytatnak az elfoglalt idegen erő ellen.