Az alkímia törvényeinek figyelmen kívül hagyása Edward Elricnek a testének fele részeit elvesztette, és Alphonse testvére lelkét egy páncéltárgyhoz köti. A elveszített visszanyeréséhez a testvérek a Filozófus Köve felé kutatnak. Ellenségek és szövetségesek – a korrumpált hadsereg, a Homunculi és a külföldi alkímia – megváltoztatják az Elric testvérek útját, de céljuk változatlan marad, és kötelékük szilárd.