בעוד 400 שנים, אחרי שמרבית האוכלוסייה תושמד על ידי מגפות, המקום הבטוח היחיד בעולם היה עיר עתידנית שבה ישלוט קונגרס של מדענים. איאון פלוקס היא לוחמת מבריקה וסקסית במחתרת המונהגת על ידי אישה. איאון נשלחת למשימה מסוכנת שמטרתה חיסול מנהיג העיר ובדרך היא חושפת עולם פוליטי אפוף סודות קטלניים.