Les mushi sont des créatures primitives aux pouvoirs sortant de l'ordinaire, à la frontière entre les êtres vivants et les choses inertes. Leur nature même empêche la plupart des humains de les distinguer, mais leur existence n'est souvent pas sans conséquence. Ginko, un homme taciturne et au passé mystérieux, est l'un de ces mushishi, ces experts en mushi ayant le don qui permet de les voir et tâchant de les faire cohabiter avec les humains. Voyageant de village en village, suivez-le dans ses aventures…