Le jeune Noé voit un jour son père, issu de la lignée de Seth, assassiné sous ses yeux par les descendants de celle de Caïn, des êtres vils qui ont corrompu le monde façonné par le Créateur. Devenu adulte et à son tour père de famille, Noé reçoit un message de Dieu lui prédisant l'Apocalypse. Un déluge va s'abattre sur la Terre dans le but d'éradiquer la méchanceté du monde.