Terroristiksi luokiteltu hakkeri, joka tunnetaan nimellä Ghost, onnistuu pakenemaan piilopaikastaan Bangkokissa viranomaisten tekemän ratsian aikana. Sosiaalisen median avulla toimiva hallituksen salainen yksikkö onnistuu hankkimaan tarpeeksi tietoa Ghostin liikkeistä - hakkeri on varannut lennon San Franciscoon ja koneeseen on saatava agentti tunnistamaan ja vangitsemaan tämä. Mutta alueella ei ole ainuttakaan omaa agenttia, joten yksikönpäällikkö Katherine Brunt päättää pakon edessä kutsua apuun häpeään joutuneen entisen agentin Lucas Reyesin, joka piilottelee Bangkokissa. Lucas ottaa vastahakoisesti tehtävän vastaan, kun Brunt lupaa puhdistaa tämän maineen. Lennon päästyä ilmaan, Lucakselle selviää, että matkustamossa on joukko eliittitappajia ympäri maailmaa, joilla jokaisella on tappokäsky sekä hänelle että Ghostille. He joutuvat tekemään yhteistyötä, sillä 11 kilometrin korkeudessa luottamus on paras ase, kun päämääränä on selviytyä hengissä kaoottisesta lennosta.