U.C. 0123. Sukupolven rauhan jälkeen Maapalloliitto on alkanut rakentaa uusia avaruussiirtokuntia kasvavan ihmiskunnan väestön majoittamiseksi. Mutta uusi joukko, aristokraattinen Crossbone Vanguard, aikoo vallata itselleen uuden Frontier Siden siirtokunnat. Kun heidän kotinsa muuttuu taistelukentäksi, joukko nuoria siviilejä kamppailee paetakseen konfliktia. Pelastaakseen ystävänsä ja perheensä, vastahakoinen soturi Seabook Arno ryhtyy uuden Gundamin ohjaajaksi, jonka koodinimi on F91.