En el año 2043, se lanzó Infinite Dendrogram, el primer VRMMO de inmersión completa exitoso del mundo. Además de su capacidad para simular a la perfección los cinco sentidos, junto con sus muchas otras características sorprendentes, el juego prometía ofrecer a los jugadores un mundo lleno de infinitas posibilidades. Casi dos años después, el futuro estudiante de primer año de la universidad, Reiji Mukudori, finalmente puede comprar una copia del juego y comenzar a jugar. Con la ayuda de su experimentado hermano mayor, Shuu, y su compañero Embryo, Reiji se embarca en una aventura en el mundo de Infinite Dendrogram.