Jim Phelps, der Geheimagent der Impossible Mission Force (IMF) aus der Originalserie, hat sich inzwischen zur Ruhe gesetzt und arbeitet als Ausbilder der Behörde. In der Pilotfolge wird sein ehemaliger Schüler Tom Copperfield, inzwischen neuer Leiter des IMF-Teams, von einem Profikiller umgebracht. Aufgrund des Todes von Copperfield, den ein väterliches Freundschaftsverhältnis mit Phelps verband, kehrt dieser in den aktiven Dienst zurück. Er stellt ein neues Team aus den Experten Nicolas Black, Max Harte, Grant Collier und Casey Randall (später Shannon Reed) zusammen und kann den Attentäter schließlich bekämpfen. Mit seiner neuen Spezialeinheit übernimmt Phelps fortan weitere geheime Sonderaufträge auf der ganzen Welt.