En supercomputer, som tilhører milliardæren og softwaregeniet Harold Finch, identificerer forestående terror- og voldshandlinger. Finch benytter sammen med den tidligere CIA-agent John Reese en ukonventionel taktik og teknologi med det formål at forhindre forbrydelser, mens de to NYPD-betjente trækkes ind i sagerne og mystikken.