Mewtwo er flyver med en gruppe af Flying-typen Pokémon over en bjergkæde, og senere, havet. Beslutter at udfordre grænserne for sin magt, Mewtwo flyver fremad, Mega udvikle sig til Mega Mewtwo Y og stigende i himlen. I mellemtiden Genesect hær ankommer til et snedækket område, at deres leder, en rød Genesect, mener at være deres hjem. Forvirret og bedrøvede, det Genesect bærer slukke Drive råber "Jeg vil hjem."