Tap Roots foregår i begyndelsen af borgerkrigen og handler om et amt i Mississippi, som vælger at løsrive sig fra staten frem for at gå ind i konflikten. Amtet er beskyttet mod Konføderationen af en abolitionist og en indfødt amerikansk gentleman. Abolitionistens datter bliver kurtiseret af en magtfuld avisudgiver, da hendes forlovede, en konfødereret officer, stikker af med pigens søster. Datteren modsætter sig først forlagets opmærksomhed, men vender sig mod ham for hjælp, da hendes eksforlovede planlægger at erobre det løsrivende amt på vegne af Sydstaterne.