Gruppen af kapere kendt som Blue Steel fortsætter deres mission med at levere tegninger af Vibrationsstridshovedtorpedoen, et våben der kan vende krigens gang til deres fordel, til USA. Dog opstår en ny trussel fra deres fjende, den overvældende Tågeflåde i form af "Studenterrådet", en gruppe krigsskibe bestående af de resterende Mentale Modeller, skibenes humanoide avatarer, som endnu ikke har stået over for den uforudsigelige kaptajn på Blue Steel, Gunzou Chihaya. Efterhånden som Blue Steel nærmer sig forståelsen af oprindelsen til den autoritet, der kontrollerer fjenden, afslører Ionas fortid begyndelsen på krigen og hendes grund til at støtte menneskeheden.