Dlouho předtím, než se Liu Kang, Sonya Blade a Johnny Cage utkali s Shang Tsungem a jeho přisluhovači v turnaji Mortal Kombat, bojoval mnich Kung Lao, zlodějka Taja a bývalý strážce Siro proti krvelačnému imperátorovi Shao Kahnovi, jeho mágovi Shang Tsungovi, jed plivajícímu Reptilovi, čaroději Quan Chimu a jeho trojici nemrtvých vražedkyň, královně Kreeye a její prvorozené dceři Vorpax či Scorpionovi. Za podpory ochránce pozemské říše lorda Raydena a princezny Kitany bojují o osud lidstva, rozhodnuti chránit ho za každou cenu, i kdyby jí měl být jejich vlastní život...